脈輪控制了內分泌腺的分泌，產生許多不同的荷爾蒙，而這些荷爾蒙流入血液，影響身體所有的器官。
因此脈輪以內分泌腺來控制身、心的活動，當腺體的分泌作用正常時，人的身體健康，心智安定。而當任一腺體功能失常時，也就是分泌作用不平衡時(無論分泌太多或太少)，便會導致身、心的疾病。
因此練習瑜伽體位法時，要知道哪些瑜伽體位法對哪些脈輪有作用，以增強其效果。
三、各腺體的功能：
1. 松果體： 松果體一般認為它是我們的生物時鐘，它能分泌出許多微妙的荷爾蒙，且足以影響身體所有器官。
目前已能分離的荷爾蒙是美拉扥寧〈Melatonin〉它可以延緩老化，增進免疫的反應，使人具有宇宙感，增加對痛苦的忍受力，減低性衝動，減少睡眠等。
而且它能從環境中諸如光線、溫度、溼度、磁場等條件，轉化為神經內分泌的反應。
當我們睡得愈深沉的時候，松果體的分泌愈多，睡德愈熟，美拉扥寧分泌愈多。
美拉扥寧由色拉扥寧〈Seratonin〉合成而來，白天時人類有意識的活動極為活躍，心靈動盪散亂，此時需要更多的色拉扥寧來供應神經細胞。
而到了晚上或靜坐時，情形就恰恰相反，有意識的活動變少了，因此有更多的色拉扥寧〈Seratonin〉合成為美拉扥寧。
2. 腦下垂腺： 與眉心輪有關聯，腦下垂體是一個非常重要的腺體，腦部直接刺激這個腺體，重生各種不同的荷爾蒙，如傳達荷爾蒙的「消息」到所有身體下方的其他腺體，刺激它們執行各種不同的任務。
以這種方法，腦下垂腺控制身體許多活動，例如腺體分泌、血液循環、生長和體溫等。
當腦下垂腺功能失常時，會產生許多疾病。而且身體會不正常的發展，或者變得很胖，或者過高，或者過於矮小。巨人症及侏儒症，就是因為腦下垂腺功能失常。
3. 甲狀腺和副甲狀腺： 與喉輪有關聯，頸部的甲狀腺和副甲狀腺，控制了身體新陳代謝的作用，此外也能調整身體所產生的熱量和能量，促進消化及成長。
若是甲狀腺分泌不正常，身心的健康都會受到嚴重的影響。
如果甲狀腺分泌稍微多點，就會感到緊張、易怒等。如果分泌再多些，則會非常的神經質、出汗、顫抖、消化不良、失眠，而迅速地消瘦。
反之，如果甲狀腺分泌稍少些時，就會疲倦，昏昏欲睡。如果分泌過少時，則行動緩慢，脈博和心跳遲緩，體溫下降，說話口齒不清，感覺遲鈍，身體發胖。
副甲狀腺控制血液中的鈣含量，負責骨骼成長的正常化。
因為骨骼需要鈣，此外，神經作用受血液中的鈣含量影響很大。如果鈣含量太少，我們會變得緊張、衝動、易怒;如果鈣含量太多，我們便會昏昏欲睡，無精打采。
因此，副甲狀腺對骨骼的發展和對神經系統的正常功能，都有很重要的影響。
4. 胸腺： 胸腺位於心臟附近的胸骨後面，於胎兒時期最為活躍，以建立起身體的免疫系統，出生後分泌胸線生成素來增強免疫系統。
其基本功能為每一個細胞打上能夠辨識的記號，防止免疫細胞反抗並摧毀我們身體自己的細胞。使身體能夠抵抗疾病的傳染。
5. 腎上腺： 與臍輪有關聯，腎上腺正位於腎臟的上方，它能使身體突然產生熱和能。
腎上腺在緊急事情發生時，尤為重要。當一個人面臨危險或急迫的事件時，如和敵人作戰，解救即將溺死的小孩，逃避火災、地震等，腦裏便會送一個信號給腎上腺，而腎上腺立即運送它的分泌物(即腎上腺素)至血液中。
腎上腺素能使心跳加速，血管擴張，且隨著血液流入肌肉，因此肌肉能從陡增的血液中，獲得更多的活能，而充分發揮工作效率。
腎上腺素還會刺激汗腺，因此雖是突然的用力使身體變熱，也能藉著出汗來排熱。此外，腎上腺素也在同時送信號到肝，使肝送出它儲藏的糖到血液中，以供身體所需的額外熱能。
如果腎上腺素分泌過少，那麼在危險、急迫時的適應能力就大大地降低了。
反之，若分泌過多，則身心將一直處於緊張的狀態中。
6. 胰腺： 與臍輪有關聯，胰腺散佈於胰臟消化腺泡之間，它分泌一種消化的荷爾蒙叫做胰島素。胰島素可減低血液中糖的成分。
如果胰島素缺乏，血糖增高，部份則隨尿排出，成糖尿，即所謂的糖尿病。
反之，如果胰島素分泌過多，則會重生血糖過低的病症，人體會有虛弱、頭痛、發抖、昏眩、神經緊張，和心緒不寧的症候出現。
7. 性腺： 與生殖輪有關聯，性腺(卵巢或睪丸)不僅能產生卵子和精子，而互相結合繁衍後代，同時它還能分泌性荷爾蒙(性腺素)，即男性激素和女性激素。
性荷爾蒙能增加男(女)性的性特徵以及調整性行為的發展。
男性激素能增加肌肉的能量，且使人富創造力、及積極性。
而女性激素能增加身體脂肪的成份，使人富於情感，思緒細密。
不論男女，在他們的體內均會產生男性激素和女性激素，不過是男性產生的男性激素多些，而女性產生的女性激素多些。
當然性荷爾蒙的比例，直接關係著男子與女子的體態、思想、情緒及心理方面。如果這些性荷爾蒙的比例失常，則女性會變得男性化，而男性也會變得女性化。
8. 瑜伽動作對腺體的影響： 人的身體可說完全受各種腺體荷爾蒙分泌所控制，每一個器官、細胞都直接受這些荷爾蒙的影響。
所以，荷爾蒙分泌正常時，人體才能正常地成長，若有任何一種腺體分泌不平衡，就會引起身心兩方面不同程度的疾病。
瑜伽動作能使各個腺體的分泌作用趨於平衡。瑜伽動作的扭轉或彎曲姿勢，通常需停頓相當一段時間，在這段時間中，所給腺體的壓力，正是要強化這些腺體，使其分泌正常。
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